Někdy v přírodě lze nalézt stromy, které zůstaly malé v důsledku přírodních okolností, jako je například nedostatek živin. Yamadori je jen jeden z mnoha způsobů jak začít vytvářet bonsaje. Samotné slovo, v doslovném překladu z japonštiny, znamená „sbírat rostliny v horách.“ Skutečný původ bonsají s největší pravděpodobností začal Yamadori. Nepříliš striktné překlady, jako například „sbírání stromů z volné přírody,“ jsou právě vhodnější pro dnešek.

Ačkoli může být obtížné úspěšně vykopat takové stromy a dopravit je domů, to jsou právě oni, které často vykazují mimořádné kvality pro účely bonsají. Je třeba mít na paměti, že je nezákonné vykopávat rostliny z lesů a je třeba získat povolení od vlastníka takového pozemku. Yamadori rostou ve volné přírodě po mnoho let, v některých případech více než sto let, než se stanou bonsajemi.

A kde se nacházejí Yamadori? Hory nejsou jediným místem, kde najít takové poklady. Ploché země, jako například Everglades na Floridě pravidelně bičují oceánské větry, ba co víc, příroda zde umí napáchat veliké škody způsobené hurikánem. V pouštních oblastech můžeme také najít jedinečné stromy, které rostly roky během sucha a odolávaly prudkým změnách teploty. Horské oblasti vystavují stromy nejtvrdším povětrnostním podmínkám, což vytváří mnoho potenciálních Yamadori bonsají. Elementy, jako jsou vítr a sníh, déšť, prudké slunce mohou vytvářet zajímavě tvarované větve ať už živé, nebo suché a stromem zajistí celkově takzvaný až zmučen vzezření.